Mekanik Arıza :Her iki sindirim sistemi türü de yiyecekleri parçalamak için mekanik işlemler kullanır. Tamamlanmamış sindirim sistemleri, gıdayı fiziksel olarak parçalamak için diş veya taşlık gibi yapıları kullanabilirken, tam sindirim sistemleri, yiyecekleri mekanik olarak işlemek için ağız, yemek borusu ve mide gibi özel yapıları kullanır.
Kimyasal Analiz :Hem eksik hem de tam sindirim sistemleri, karmaşık gıda moleküllerini kimyasal olarak daha basit bileşenlere parçalamak için enzimlerden yararlanır. Sindirim sistemindeki çeşitli organ ve bezler tarafından üretilen enzimler, karbonhidratların, proteinlerin ve lipitlerin glikoz, amino asitler ve yağ asitleri gibi daha küçük moleküllere parçalanmasını kolaylaştırır.
Soğurma :Besinlerin sindirilmiş gıdalardan emilmesi hem eksik hem de tam sindirim sistemlerinde meydana gelir. Her iki durumda da, tam sindirim sistemindeki ince bağırsak veya tamamlanmamış sindirim sistemindeki gastrovasküler boşluk gibi özel yapılar, besinlerin kan dolaşımına emilmesini kolaylaştırır.
Atık Giderme :Hem eksik hem de tam sindirim sistemleri, sindirilmemiş gıdaları ve atık ürünleri ortadan kaldıracak mekanizmalara sahiptir. Tamamlanmamış sindirim sistemleri, yiyecekleri sindirmek için kullanılan aynı açıklıktan atıkları dışarı atabilirken, tam sindirim sistemleri, atıkların ortadan kaldırılmasına adanmış anüs veya kloaka gibi özel yapılara sahiptir.