Şu anda çölyak hastalığının veya gluten intoleransının tedavisi yoktur. . Teşhis konulduktan sonra tek tedavi glutensiz diyete sıkı sıkıya bağlı kalmaktır. Bu, buğday, arpa, çavdar ve bu tahılları içeren gıdalar da dahil olmak üzere tüm gluten kaynaklarının diyetten tamamen çıkarılması anlamına gelir.