Sindirim sisteminin sinir beslemesi otonom sinir sistemi tarafından sağlanır. Vagus siniri, farenksten inen kolona kadar sindirim sisteminin büyük bir bölümünü innerve eden birincil parasempatik sinirdir. Sempatik sinirler torakolomber çıkıştan oluşur (lifler T5-L2 omurilik segmentlerinden kaynaklanır).
Kan Temini
Sindirim sistemi büyük ölçüde aortun abdominal kısmının visseral dalları ve çölyak ve superior mezenterik arterlerin dalları tarafından sağlanır. Karaciğer mideden sonra oksijenli kanı alan ilk organdır. Çölyak arteri mide, duodenum, karaciğer, dalak ve pankreasa kan sağlarken, superior mezenterik arter ince bağırsakların ve kolonun geri kalanını besler. Rektum ve anüs alt rektal arterler tarafından beslenir.