Boşaltım sindirim sisteminin bir fonksiyonu değildir. Sindirim sisteminin temel işlevleri, gıdanın mekanik ve kimyasal olarak vücudun emebileceği besin maddelerine parçalanmasının yanı sıra bu besinlerin emilimini ve kullanımını içerir. Atık ürünlerin vücuttan atılmasını içeren boşaltım işlemi öncelikle üriner sistem ve solunum sistemi tarafından gerçekleştirilir.