Mide proteini daha küçük peptitlere parçaladıktan sonra bu peptitler ince bağırsağa taşınır. İnce bağırsakta pankreas, peptitleri ayrı ayrı amino asitlere parçalayan trypsin, kimotripsin ve elastaz gibi enzimleri salgılar. Bu amino asitler daha sonra kan dolaşımına emilir ve karaciğere taşınır; burada yeni proteinlerin sentezlenmesinde veya enerji için parçalanmasında kullanılırlar.