Öte yandan deniz hıyarı gibi derisi dikenlilerin farklı bir sindirim sistemi vardır. Vücutlarının içinden geçen uzun, sarmal bir bağırsağa sahiptirler. Bağırsak, yutulan gıdalardan besin maddelerinin emilmesi için uzmanlaşmıştır. Deniz hıyarları tortuda bulunan organik maddelerle beslenir ve sindirim sistemleri bu maddelerin parçalanmasına ve emilmesine yardımcı olur.
Genel olarak derisi dikenlilerin genel besleyiciler olduğu biliniyor, bu da onların çok çeşitli besin kaynaklarına sahip olduğu anlamına geliyor. Farklı türler algler, döküntüler, küçük omurgasızlar ve hatta diğer derisi dikenlilerle beslenebilir. Her grubun spesifik sindirim sistemi adaptasyonları, onların çeşitli besin kaynaklarından yararlanmalarına ve kendi çevrelerinde hayatta kalmalarına olanak tanır.