1. Epitel dokusu: Bu doku ağız, yemek borusu, mide, ince bağırsak ve kalın bağırsak dahil olmak üzere sindirim sisteminin iç yüzeyini kaplar. Alttaki dokuları aşınmaya karşı korur ve besinlerin emilimini kolaylaştırır.
2. Bağ dokusu: Bu doku sindirim organlarına destek ve yapı sağlar ve aynı zamanda onları vücuttaki diğer yapılara bağlar. İçinde kan damarları, lenfatik damarlar ve sinirler bulunur.
3. Kas dokusu: Sindirim sistemi, yiyecekleri sindirim sistemi boyunca iten peristaltik hareketlerden sorumlu olan düz kas dokusunu içerir.
4. Glandüler doku: Bu doku, tükürük bezleri, mide bezleri ve bağırsak bezleri gibi sindirim sistemiyle ilişkili çeşitli bezleri oluşturur. Bu bezler enzimler, mukus ve yiyeceklerin sindirimine yardımcı olan diğer maddeleri üretir.