Makromoleküllerin çoğu ince bağırsakta sindirilir. İnce bağırsak, mideyi kalın bağırsağa bağlayan uzun, sarmal bir tüptür. Bağırsak yüzey alanını artıran ve besinlerin emilmesine yardımcı olan küçük, parmak benzeri çıkıntılar olan villuslarla kaplıdır. İnce bağırsak ayrıca makromolekülleri kan dolaşımına emilebilecek daha küçük moleküllere parçalayan enzimler de üretir.