Jaguarlar, tüm memeliler gibi vücutlarında hareket etmeyi ve çeşitli vücut fonksiyonlarını sağlayan çok sayıda kas içerir. Bir jaguardaki kasların tam sayısı anatomik sınıflandırma yöntemlerine göre değişiklik gösterse de genel bir tahmin, bir jaguarın vücudunda yaklaşık 639 iskelet kası bulunduğunu göstermektedir. Bu kaslar yürüme, koşma, tırmanma, avlanma gibi çeşitli hareketlerin yanı sıra kur yapma ve bölgesel gösteriler gibi sosyal davranışlardan sorumludur.