Sindirim semptomları:
* Kronik ishal
* Karın ağrısı ve şişkinlik
* Gaz
* Kabızlık
* Bulantı ve kusma
* Kilo kaybı
* Yetersiz beslenme
* Demir eksikliği anemisi
* Yüzen yağlı dışkı
Diğer belirtiler:
* Tükenmişlik
* Zayıflık
* Eklem ağrıları ve kas krampları
* Kısırlık
* Düşük
* Deri döküntüleri
* Diş minesi kusurları
*Depresyon, anksiyete ve kognitif bozukluk gibi nörolojik problemler
Çölyak hastalığı ayrıca aşağıdakiler gibi daha az görülen başka semptomlara da neden olabilir:
* Splenomegali (dalak büyümesi)
* Hepatomegali (karaciğer büyümesi)
* Pankreatit (pankreas iltihabı)
* Tiroid hastalığı
* Tip 1 diyabet
* Addison hastalığı
* Dermatitis herpetiformis (kaşıntılı, kabarcıklı döküntülerle karakterize kronik bir cilt rahatsızlığı)