Escherichia coli (E. coli) fakültatif anaerob olarak sınıflandırılabilir. Bu, E. coli'nin oksijen varlığında (aerobik koşullar) hayatta kalabilmesine rağmen, oksijen yokluğunda da (anaerobik koşullar) hayatta kalabileceği anlamına gelir. Aerobik koşullar altında E. coli, organik bileşikleri parçalamak ve enerji üretmek için oksijeni kullanan bir süreç olan hücresel solunumu gerçekleştirir. Oksijen olmadığında E. coli, organik bileşikleri oksijen kullanmadan parçalayan ve ATP formunda enerji üreten bir süreç olan fermantasyona geçebilir. Fakültatif bir anaerob olarak E. coli farklı ortamlara uyum sağlayabilir ve mevcut en verimli enerji üretim yolunu kullanabilir.