Oksijen yokluğunda sindirim için kullanılan terim anaerobik sindirimdir. Bu süreç, oksijen olmadan organik maddeyi parçalayabilen bakteri ve arkeler gibi bazı mikroorganizmalarda meydana gelir. Anaerobik çürütme, atık su arıtma tesislerinde ve biyogaz üretim tesislerinde, organik atıkları yenilenebilir enerji kaynağı olarak kullanılabilen metan ve karbondioksit karışımı olan biyogaza dönüştürmek için yaygın olarak kullanılmaktadır.