Dalak: Kala azar'da en sık ve ciddi şekilde etkilenen organ dalaktır. Büyür, sıkışır ve sertleşir, genellikle normal boyutunun birkaç katı ağırlığa ulaşır. Bu genişleme karın rahatsızlığına, ağrıya ve dolgunluk hissine neden olabilir.
Karaciğer: Kala azarda karaciğer de yaygın olarak etkilenir. Dalağa benzer şekilde genişler ve tıkanır. Şiddetli vakalarda, sarılığa, asit (karın bölgesinde sıvı birikmesi) ve karaciğer fonksiyonunda bozulmaya yol açan karaciğer hasarı meydana gelebilir.
Kemik iliği: Kemik iliği, Leishmania parazitlerinin çoğaldığı ve vücutta yayıldığı yerdir. Parazitlerin kemik iliğine sızması kan hücresi üretiminin azalmasına neden olabilir, bu da anemi, trombositopeni (düşük trombosit sayısı) ve lökopeni (düşük beyaz kan hücresi sayısı) ile sonuçlanır.
Kala azar, bu birincil organlara ek olarak deri, lenf düğümleri ve gastrointestinal sistem gibi vücudun diğer kısımlarını da etkileyebilir. Kala azarın spesifik semptomları ve komplikasyonları kişiye ve enfeksiyonun ciddiyetine bağlı olarak değişebilir.