1) Primer İmmün Yetmezlik Hastalıkları (PID):Bağışıklık sisteminin gelişimini ve fonksiyonunu etkileyen genetik bozukluklardan kaynaklanır. Örnekler arasında Şiddetli Kombine İmmün Yetmezlik (SCID), X'e bağlı Agammaglobulinemi, Wiskott-Aldrich Sendromu ve DiGeorge Sendromu yer alır.
2) İkincil Bağışıklık Yetmezliği Hastalıkları:Enfeksiyonlar (HIV/AIDS gibi), bazı ilaçlar, yetersiz beslenme, kronik hastalıklar (diyabet, kanser gibi), yaşlanma gibi dış faktörlere bağlı olarak ortaya çıkan edinilmiş bağışıklık yetmezlikleridir.