Pepsinojenin pepsine dönüşümü birkaç adımdan oluşur:
1. Protonasyon:Hidrojen iyonları, pepsinojen molekülündeki spesifik amino asit kalıntılarına bağlanarak onun konformasyonel bir değişikliğe uğramasına neden olur. Bu konformasyonel değişiklik enzimin aktif bölgesini açığa çıkarır.
2. Otokatalitik Aktivasyon:Pepsinojenin açığa çıkan aktif bölgesi, pepsinojen molekülü içindeki iki spesifik amino asit arasındaki peptit bağını parçalayabilir. Bu bölünme, pepsinojeni pepsine aktive eden küçük bir peptidin salınmasıyla sonuçlanır.
3. Pepsin ile Daha Fazla Aktivasyon:Az miktarda pepsin aktive edildikten sonra, pozitif bir geri besleme mekanizması yoluyla ek pepsinojen moleküllerini daha da aktive edebilir. Pepsin, pepsinojendeki spesifik amino asitler arasındaki peptit bağını kopararak onu aktif pepsine dönüştürür.
Bu işlem, pepsinin yalnızca midenin asidik ortamında aktive olmasını sağlar; burada proteinleri daha küçük peptitler halinde parçalamak için en iyi şekilde işlev görebilir.