Bununla birlikte HRT'nin ayrıca kan pıhtılaşması, felç ve belirli kanser türlerinde artış riski de dahil olmak üzere bazı riskleri vardır. HRT'nin riskleri ve faydaları, her kadının sağlık geçmişine ve kişisel tercihlerine bağlı olarak değişir.
Bu nedenle HRT'yi kullanıp kullanmamaya karar vermeden önce bir sağlık uzmanıyla HRT'nin artıları ve eksileri hakkında konuşmak önemlidir.
Genel olarak, HRT en çok orta ila şiddetli menopoz semptomları yaşayan ve HRT ile ilişkili yan etkiler geliştirme riski düşük olan kadınlara önerilir. Hafif menopoz semptomları yaşayan veya HRT'ye bağlı yan etkiler geliştirme riski yüksek olan kadınlar için hormonal olmayan tedaviler daha iyi bir seçenek olabilir.