İnce bağırsakta kimus, karaciğerden gelen safra ve pankreastan gelen enzimlerle karışarak gıdadaki karbonhidratların, proteinlerin ve yağların daha fazla parçalanmasına yardımcı olur. İnce bağırsağın duvarları, besinlerin emilimi için yüzey alanını artıran, villus adı verilen parmak benzeri küçük çıkıntılarla kaplıdır. Besinler daha sonra villus yoluyla kan dolaşımına emilir.
İnce bağırsaktan geçtikten sonra kalan sindirilmemiş yiyecekler kalın bağırsağa veya kolona doğru hareket eder. Kolonda su ve elektrolitler emilir ve geri kalan atık madde dışkıya dönüşür. Dışkı daha sonra anüs yoluyla vücuttan atılıncaya kadar rektumda saklanır.
Genel olarak sindirim sistemi, yiyecekleri daha sonra vücut tarafından enerji ve büyüme için kullanılan bileşen besin öğelerine ayırmada hayati bir rol oynar. Ayrıca atık ürünleri vücuttan uzaklaştırır.