Pepsin, gıdalardaki proteinleri parçalayan bir sindirim enzimidir. Midede üretilir ve asidik ortamda en iyi şekilde çalışır. Hidroklorik asit de midede üretilir ve bu asidik ortamı oluşturur. Yani pepsin ve hidroklorik asit midede besinleri parçalamak için birlikte çalışır.
Ancak hidroklorik asit çok aşındırıcıdır ve uygun şekilde düzenlenmezse mide zarına zarar verebilir. Mide kendini korumak için mide duvarını kaplayan bir mukus tabakası üretir. Bu mukus tabakası mide zarının hidroklorik asit ve pepsinden korunmasına yardımcı olur.