Çölyak hastalığı ince bağırsağa zarar veren otoimmün bir durumdur. Buğday, arpa, çavdar ve diğer bazı tahıllarda bulunan bir protein olan glutene karşı bağışıklık reaksiyonu tarafından tetiklenir. Çölyak hastalığı olan bir kişi gluteni yediğinde bağışıklık sistemi ince bağırsağa saldırarak iltihaplanma ve hasara neden olur. Bu hasar karın ağrısı, ishal, kilo kaybı ve anemi gibi çeşitli semptomlara yol açabilir.
Kolonoskopi, ince bağırsakta gelişebilen nadir bir kanser türü olan ince bağırsak lenfoması gibi çölyak hastalığının belirli komplikasyonlarının tespit edilmesine yardımcı olabilir. Ancak çölyak hastalığının teşhisinde kolonoskopi tercih edilen yöntem değildir.
Çölyak hastalığını teşhis etmek için tercih edilen yöntem kan testidir. Bir kan testi, kandaki çölyak hastalığıyla ilişkili belirli antikorların düzeylerini ölçebilir. Kan testi sonuçları çölyak hastalığını gösteriyorsa tanıyı doğrulamak için ince bağırsaktan biyopsi yapılabilir.