1. Kardiyovasküler sistem :Marfan sendromu kalbi ve kan damarlarını etkiler. Marfan sendromlu bireylerde aort kökü dilatasyonu, aort diseksiyonu, mitral kapak prolapsusu ve diğer kalp problemleri gelişebilir.
2. İskelet sistemi :Marfan sendromu kemikleri, eklemleri ve kasları etkiler. Marfan sendromlu bireyler uzun boylu, ince ve uzun uzuvlara sahip olabilir ve skolyoz ve pes planus (düztabanlık) gibi eklem problemleri geliştirebilirler.
3. Oküler sistem :Marfan sendromu gözleri etkiler. Marfan sendromlu bireylerde, göz merceğinin yerinden çıktığı ektopia lentis'in yanı sıra miyopi (yakını görememe) ve retina dekolmanı gibi diğer göz problemleri gelişebilir.
4. Akciğer sistemi :Marfan sendromu akciğerleri etkileyebilir. Marfan sendromlu bireylerde akciğer çökmesi anlamına gelen spontan pnömotoraks gelişebilir.
5. Nörolojik sistem :Marfan sendromu beyni ve sinir sistemini etkileyebilir. Marfan sendromlu bireylerde, beyin dokusunun omurilik kanalına uzandığı bir durum olan Chiari malformasyonu tip 1 gelişebilir.
6. Cilt ve yumuşak doku sistemi :Marfan sendromu cildi ve yumuşak dokuları etkileyebilir. Marfan sendromlu bireylerde stria (çatlaklar), kasık fıtığı ve göbek fıtığı gelişebilir.