PKOS'lu kadınlarda androjen gibi bazı hormonlar daha yüksek seviyelerde bulunabilir ve bu hormonlar dişi fetüste üreme sisteminin gelişimini etkileyebilir. Bu, kız bebekte daha sonraki yaşamda polikistik over sendromu veya diğer hormonal dengesizlikler gibi durumlara yol açabilir. Ancak bunlar geleneksel anlamda doğum kusurları olarak kabul edilmez.
PKOS'lu kadınların hem kendileri hem de bebekleri için mümkün olan en iyi sonuçları sağlamak amacıyla hamilelik sırasında uygun doğum öncesi bakım ve izleme almaları önemlidir.