Karaciğer biyopsisi çoğunlukla ultrason veya CT taraması gibi görüntü kılavuzlu teknikler kullanılarak gerçekleştirilir. İşlem sırasında doktor, küçük bir doku örneği toplamak için deriden karaciğere ince bir iğne sokar. Bu doku daha sonra bir patolog tarafından mikroskop altında incelenerek kanser hücreleri aranır.
Bazı durumlarda doku örneğini elde etmek için cerrahi biyopsi gerekli olabilir. Bu tip biyopsi ameliyathanede genel anestezi altında yapılır.