Burun boşluğuna uygulanan bir aşı, üreme sistemini değil, solunum sistemini koruyacaktır. Burun boşluğu, solunum sisteminin bir parçasıdır ve burun yoluyla verilen aşılar, üst solunum yollarının (burun boşluğu, ağız ve boğaz dahil) mukozal bağışıklığını hedef alır. Mukozal bağışıklık, solunum yolu enfeksiyonlarının önlenmesinde veya ciddiyetinin azaltılmasında çok önemli bir rol oynar.
Aşının burun boşluğuna verilmesiyle, solunum sisteminin bağışıklık sistemi, hedeflenen hastalık veya patojeni tanıyabilir ve buna karşı hedeflenen bir bağışıklık tepkisi geliştirebilir. Bununla birlikte, burun boşluğuna uygulanan aşıların tipik olarak üreme sistemini değil, öncelikle solunum sistemini etkileyen hastalıklara karşı koruma sağlaması amaçlanmaktadır.