1. Kas kütlesini hesaba katmaz: BMI kas ve yağ kütlesi arasında ayrım yapmaz. Çok kaslı insanlar, vücut yağ yüzdeleri düşük olmasına ve sağlık durumları iyi olmasına rağmen yüksek BMI'ye sahip olabilirler.
2. Belirli popülasyonlarda obeziteyi hafife alıyor: BMI, sporcular ve vücut geliştiriciler gibi kas kütlesi daha yüksek olan kişilerde obeziteyi hafife alma eğilimindedir. Bunun nedeni kasın yağdan daha ağır olmasıdır, bu nedenle bu bireylerin vücut yağ yüzdelerinin önerdiğinden daha yüksek bir BMI'ye sahip olmaları mümkündür.
3. Belirli popülasyonlarda obeziteyi olduğundan fazla tahmin ediyor: BMI, yaşlı yetişkinlerde ve Asya ve Güney Asya popülasyonları gibi belirli etnik kökenlere sahip kişilerde obeziteyi olduğundan fazla tahmin etme eğilimindedir. Bunun nedeni, bu grupların belirli bir BMI'da diğer popülasyonlarla karşılaştırıldığında daha yüksek vücut yağ yüzdesine sahip olma eğiliminde olmalarıdır.
4. Vücut yağ dağılımı hakkında bilgi sağlamaz: BMI, vücut yağının nasıl dağıldığı hakkında herhangi bir bilgi sağlamaz. Bel çevresinde aşırı kilo taşıyan kişiler (elma tipi obezite), daha dengeli kilo taşıyan kişilere (armut tipi obezite) göre daha fazla sağlık sorunu riski altındadır.
5. Yaş, cinsiyet ve diğer faktörler dikkate alınmaz: BMI, kişinin kilosunu ve sağlık durumunu etkileyebilecek yaş, cinsiyet ve aktivite düzeyi gibi bireysel faktörleri hesaba katmaz.
6. Belirli tıbbi rahatsızlıkları olan kişiler için yanıltıcı olabilir: BMI, sıvı tutulumu, ödem veya kiloyu etkileyebilecek bazı ilaçlar gibi belirli tıbbi rahatsızlıkları olan kişiler için doğru bir sağlık ölçüsü olmayabilir.
Bu nedenlerden dolayı, kişinin sağlığına ilişkin daha kapsamlı bir tablo elde etmek için BMI, bel çevresi, vücut yağ yüzdesi ve genel sağlık durumu gibi diğer sağlık ölçümleriyle birlikte kullanılmalıdır.