Mide kanseri midenin herhangi bir yerinde başlayabilir ancak en sık mide zarında başlar. Mide astarı, mukozal katman, submukozal katman ve muskularis katman dahil olmak üzere çeşitli hücre katmanlarından oluşur. Mide kanseri bu katmanlardan herhangi birinde başlayabilir ancak en sık mukozal katmanda başlar.