Gram pozitif organizmaların hücre duvarlarında kalın bir peptidoglikan tabakası bulunur, bu da onları bazı antibiyotiklere ve antimikrobiyal ajanlara karşı daha dirençli kılar. Bununla birlikte, iyot peptidoglikan tabakasına nüfuz edebilir ve sitoplazmik membrana ulaşabilir, burada hasara neden olabilir ve bakterileri öldürebilir.
Gram negatif organizmalar daha ince bir hücre duvarına ve bazı antimikrobiyal ajanlara karşı bariyer görevi görebilen bir dış zara sahiptir. Bununla birlikte, iyot dış zarı geçebilir ve gram negatif bakterilerin sitoplazmik zarına ulaşabilir ve burada antimikrobiyal etkilerini gösterebilir.
İyot, yaraları dezenfekte etmek ve enfeksiyonu önlemek için genellikle topikal bir antiseptik olarak kullanılır. Ayrıca su arıtma, gıda muhafazası ve yüzeylerin sanitizasyonu gibi diğer çeşitli uygulamalarda da kullanılır.
İyotun çoğu bakteriye karşı etkili olmasına rağmen, bazı istisnaların ve iyodine direnç gösterebilecek bazı bakteri türlerinin olabileceğini unutmamak önemlidir. Uygun konsantrasyon, maruz kalma süresi ve spesifik formülasyon da iyotun mikroorganizmalara karşı etkinliğini etkileyebilecek faktörlerdir.