Mide suyunda bulunan ve proteinleri sindiren enzim pepsindir. Pepsin, midedeki mide bezlerinin baş hücreleri tarafından salgılanan bir proteaz enzimidir. Midenin asidik ortamında aktiftir ve proteinleri daha küçük peptitlere ayırır. Pepsin özellikle et ve diğer hayvansal ürünlerin sindirimi için önemlidir. Karmaşık proteinleri vücut tarafından daha kolay emilebilecek daha küçük moleküllere parçalamak için hidroklorik asit gibi diğer enzimlerle birlikte çalışır.