* İşlevsel bozukluklar: Bunlar sindirim sisteminin çalışma şeklini etkileyen ancak altta yatan herhangi bir hastalıktan kaynaklanmayan durumlardır. Örnekler arasında irritabl bağırsak sendromu (IBS), Crohn hastalığı ve ülseratif kolit yer alır.
* Yapısal bozukluklar: Bunlar sindirim sisteminin fiziksel yapısını etkileyen durumlardır. Örnekler arasında fıtıklar, polipler ve tümörler bulunur.
* Kötü huylu hastalıklar: Bunlar sindirim sisteminde başlayan kanserlerdir. Örnekler arasında yemek borusu kanseri, mide kanseri, kolon kanseri ve rektum kanseri yer alır.