Endokondral ossifikasyon, kıkırdağın kemikle değiştirilmesiyle kemiğin oluşturulduğu süreçtir. Uzun kemiklerde meydana gelir ve aşağıdaki adımları içerir:
1. Kondrositler kıkırdak matrisinde bölünür ve büyür, kemiğin kıkırdak modelini oluşturur.
2. Kan damarları kıkırdak modelini istila ederek kondrositlere oksijen ve besin getirir.
3. Osteoblastlar Kemik oluşturan hücreler olan mezenkimal hücrelerden farklılaşır ve kıkırdak modelinin etrafına bir kemik matrisi tabakası biriktirir.
4. Kıkırdak modelinin merkezindeki kondrositler ölür ve geride medüller boşluk adı verilen içi boş bir alan kalır. .
5. Osteoblastlar korteksi oluşturacak şekilde medüller boşluk çevresinde kemik matrisi biriktirmeye devam edin kemikten.
6. Epifizler adı verilen kemiğin uçları , endokondral ossifikasyon adı verilen ayrı bir süreçle oluşturulur . Epifizlerde kıkırdak modelinin yerini yukarıda anlatılana benzer bir süreçle kemik alır.
Bu nedenle, endokondral ossifikasyonda, osteoblastlar matriksteki kondrositlerin yerini alarak kemik oluştururlar, bunun tersi olmaz.