Bağışıklık sisteminin mikropları yok etmek ve kontrol altına almak için çeşitli mekanizmaları vardır. Nötrofiller, makrofajlar ve T hücreleri gibi özelleşmiş beyaz kan hücreleri, patojenleri yok etmede ve onlarla savaşmada çok önemli bir rol oynar. Ek olarak, bağışıklık sistemi tarafından üretilen antikorlar mikroplarla etkileşime girerek onları bağışıklık hücreleri tarafından yok edilmek üzere işaretler veya bulaşıcılıklarını önler.