Hastane ortamında klamidyaya yakalanma olasılığı son derece düşüktür. Klamidya genellikle korunmasız cinsel temas yoluyla veya enfekte bir anneden doğum sırasında bebeğine bulaşır. Hastanelerde, klamidya da dahil olmak üzere enfeksiyonların yayılmasını önlemek için sıkı enfeksiyon kontrol önlemleri ve protokolleri bulunmaktadır. Bu önlemler, potansiyel olarak bulaşıcı malzemelerle çalışırken steril ekipman kullanımını, el hijyenini ve uygun bariyer önlemlerini (prezervatif ve kişisel koruyucu ekipman gibi) içerir. Klamidya testi ve tedavisi, şüpheli vakaları etkili bir şekilde önlemek ve ele almak için hastane ortamlarında veya ayakta tedavi kliniklerinde de kolaylıkla yapılabilir.