BBB geçirgenliği açısından son derece seçicidir; oksijen, glikoz ve su gibi belirli maddelerin geçmesine izin verirken toksinler, patojenler ve çoğu ilaç gibi diğer maddelerin girişini engeller. Bu seçicilik, beynin düzgün işleyişini sürdürmek ve onu hasardan korumak için gereklidir.
Ancak BBB tamamen geçirimsiz değildir. Yağda çözünen moleküller ve su ve oksijen gibi küçük moleküller gibi bazı maddeler KBB'den serbestçe geçebilir. Ek olarak belirli proteinler ve peptitler, reseptör aracılı transsitoz gibi spesifik taşıma mekanizmaları yoluyla BBB boyunca taşınabilir.
KBB aynı zamanda dinamiktir ve yaralanma, iltihaplanma veya hastalık gibi çeşitli faktörlere yanıt olarak değişikliklere uğrayabilir. Bazı patolojik durumlarda, BBB daha geçirgen hale gelebilir ve normalde hariç tutulacak maddelerin girişine izin verebilir. Bunun beyin hastalıklarının gelişimi ve tedavisi üzerinde önemli etkileri olabilir.
Genel olarak BBB, beynin ortamını düzenlemede ve onu zararlı maddelerden korumada çok önemli bir rol oynayan CNS'nin kritik bir bileşenidir. Seçici geçirgenliği beynin düzgün işleyişini ve bütünlüğünü korumak için gereklidir.