Ayrıca ağır zincirlerin sabit bölgeleri IgG ve IgM antikorları arasında farklıdır. Bu sabit bölgeler, antikorların, kompleman proteinlerine veya bağışıklık hücreleri üzerindeki Fc reseptörlerine bağlanma gibi efektör işlevlerinden sorumludur. IgG ve IgM antikorlarının sabit bölgelerindeki farklılıklar, farklı efektör fonksiyonlara sahip olmalarını sağlar.
Örneğin, IgG antikorları kompleman proteinlerine bağlanabilir ve kompleman kaskadını aktive edebilir, bu da hedef hücrelerin yok olmasına yol açar. IgM antikorları tamamlayıcı proteinlere bağlanamaz, ancak bağışıklık hücreleri üzerindeki Fc reseptörlerine bağlanıp onları aktive edebilir ve bu da inflamatuar aracıların salınmasına yol açabilir.