1. Geçerli Tıbbi İnanışlar :O zamanlar birçok doktor, çeşitli hastalıkların birincil tedavisi olarak "kanama" veya kan alma uygulamasının olduğuna inanıyordu. Jenner'ın çiçek hastalığına karşı önleyici bir tedbir olarak inek çiçeği aşısını kullanma önerisi, bu yerleşik uygulamaya meydan okudu.
2. Yan Etkilerden Korkmak :Bazı doktorlar aşılamanın olası olumsuz etkilerinden endişe duyuyordu. Yabancı maddelerin (sığır çiçeği materyali gibi) vücuda sokulmasının istenmeyen sağlık sorunlarına neden olabileceğini savundular. Jenner'ın ampirik gözlemleri ve bu endişeleri destekleyecek kanıtların bulunmaması, başlangıçta tüm şüphecileri ikna etmek için yeterli değildi.
3. Tıbbi Rekabetler :Jenner'ın çalışmaları geniş çapta tanındı ve kamuoyunun ilgisini çekti, bu da onu tıp dünyasında önemli bir figür haline getirdi. Bazı doktorlar onun başarısının gölgesinde kaldığını veya tehdit altında olduğunu hissettiler ve bulgularını itibarsızlaştırmak için kişisel saldırılara ve eleştirilere giriştiler.
4. Halkın Direnişi :Toplum da aşı konusunda tereddütlüydü. Pek çok kişi, bunun "hayvanlaştırmaya" veya başka olumsuz sonuçlara yol açabileceğine inanarak, bir kişiye bir hayvandan materyal enjekte etme uygulamasından korkuyordu. Aşılamanın güvenliği ve etkinliğine ilişkin söylentiler ve komplo teorileri ortalıkta dolaşarak direnci daha da artırdı.
5. Dini ve Ahlaki İtirazlar :Bazı kişiler, aşıyı Allah'ın iradesine bir müdahale veya insan vücudu üzerinde bir tür "deney" olarak değerlendirerek dini gerekçelerle aşıya karşı çıktı. Hayvanlardan elde edilen materyallerin (özellikle sığır çiçeği aşısı için) kullanılmasına ilişkin etik kaygılar da bazı topluluklarda muhalefete katkıda bulundu.
6. Bilimsel Anlayış Eksikliği :Aşılama o zamanlar henüz nispeten yeni bir kavramdı ve bağışıklığa ilişkin bilimsel anlayış henüz tamamlanmamıştı. Aşılamanın nasıl çalıştığına dair temel prensipleri herkes anlamadı, bu da aşının etkinliği ve güvenliği konusunda şüphelere yol açtı.
7. Geleneksel Uygulamalar :Birçok kişi geleneksel halk ilaçlarına güçlü bir inanç duyuyordu ve zamanla test edilmiş uygulamaların aşılama gibi yeni çıkmış fikirlerden daha güvenilir ve emniyetli olduğuna inanıyordu. Geleneksel uygulamalardan kopmak ve yeni yaklaşımları benimsemek bazı bireyler için önemli bir zorluktu.
Muhalefete rağmen, Edward Jenner'ın bilimsel kanıtlara olan sarsılmaz bağlılığı, sürekli deneyleri ve aşılama yönteminin başarısı, sonunda aşılamanın hayat kurtaran bir tıbbi müdahale olarak yaygın şekilde kabul edilmesine yol açtı. Ancak aşılamanın dünya çapında sağlık sistemlerinde yaygın olarak kabul edilen ve geniş çapta benimsenen bir uygulama haline gelmesi birkaç on yıl aldı.