Ekolojik Çöküş :Aşırı nüfus ve yoğun tarım nedeniyle ormansızlaşma ve toprak erozyonu, tarımsal üretimde düşüşe yol açarak gıda kıtlığına ve kıtlığa yol açmış olabilir.
Kuraklık ve İklim Değişikliği :Uzun süreli kuraklıklar ve iklim düzenlerindeki değişiklikler, tarımsal üretimi ve su kaynaklarını kesintiye uğratarak gıda kıtlığına ve toplumsal huzursuzluğa yol açabilir.
Savaş ve Siyasi İstikrarsızlık :Copán, komşu Maya şehir devletleriyle, şehri zayıflatmış ve gerilemesine katkıda bulunmuş olabilecek çeşitli çatışmalara karışmıştı. İç siyasi istikrarsızlık ve güç mücadeleleri durumu daha da kötüleştirebilirdi.
Ticaret Kesintisi :Ticaret yollarındaki değişiklikler ve uzun mesafeli ticaret ağlarının azalması, Copán'ın ekonomisini etkileyerek zenginlik ve kaynak kaybına yol açmış olabilir.
Hastalık ve Salgınlar :Sarıhumma veya sıtma gibi hastalıkların ve salgın hastalıkların yayılması nüfusun büyük bir kısmını yok edebilir ve şehrin kendini ayakta tutma kabiliyetini zayıflatabilirdi.
Bunların sadece teori olduğunu ve Copán'ın çöküşünün kesin nedenlerinin hala bilim adamları arasında tartışıldığını belirtmek önemlidir. Muhtemelen şehrin gerilemesine ve sonunda terk edilmesine yol açan çeşitli faktörlerin bir kombinasyonuydu.