Kemiklerde kollajen lifleri, bir kalsiyum fosfat minerali olan hidroksiapatitin birikmesi için bir iskele sağlayan bir matris içinde düzenlenir. Hidroksiapatit kristalleri kollajen lifleri üzerinde birikerek sert ve güçlü bir kompozit malzeme oluşturur. Bu mineralizasyon süreci kemiklerin düzgün gelişimi ve bakımı için gereklidir.
Kolajen olmasaydı kemikler çok daha zayıf ve kırılmaya daha yatkın olurdu. Kollajen ayrıca kemik yoğunluğunun ve esnekliğinin korunmasına da yardımcı olur. İnsanlar yaşlandıkça kollajen kaybederler ve bu da zayıf ve kırılgan kemiklerle karakterize bir durum olan osteoporoza yol açabilir.