Kara Ölüm'ün ortaçağ tıbbı üzerinde derin bir etkisi oldu. Çoğu zaman batıl inançlara ve dini inançlara dayanan geleneksel tıbbi uygulamaların sınırlarını ortaya çıkardı. Aynı zamanda daha iyi hijyen ve sanitasyon ihtiyacının da altını çizdi.
Kara Ölüm'den öğrenilen en önemli derslerden biri tecrit ve karantinanın önemiydi. Veba kurbanlarıyla temas halinde olan kişilerin hastalığa yakalanma olasılığının daha yüksek olduğu keşfedildi. Sonuç olarak birçok şehir ve kasaba, sınırları kapatmak ve enfekte kişileri izole etmek gibi karantina önlemlerini uygulamaya başladı.
Kara Ölüm'den öğrenilen bir diğer önemli ders ise temiz su ve sanitasyonun önemiydi. Temiz suya ve iyi sanitasyona sahip şehirlerde yaşayan insanların vebaya yakalanma olasılığının daha düşük olduğu tespit edildi. Sonuç olarak birçok şehir su temini ve sanitasyon sistemlerini iyileştirmeye başladı.
Son olarak Kara Ölüm, yeni tıbbi tedavilerin geliştirilmesine yol açtı. En önemli gelişmelerden biri kan almanın kullanılmasıydı. Kan alma, Orta Çağ'da yaygın bir tıbbi uygulamaydı, ancak Kara Ölüm kurbanlarının tedavisinde özellikle etkili olduğu görüldü.
Kara Ölüm, Orta Çağ Avrupa'sında yıkıcı bir etki yarattı, ancak aynı zamanda tıbbi bilgi ve uygulamalarda da önemli ilerlemelere yol açtı. Kara Ölüm'den alınan dersler modern tıbbın gelişiminin şekillenmesine yardımcı oldu.