* Bağışıklık hücrelerinin doğrudan enfeksiyonu. Çocuk felci virüsü, T hücreleri ve B hücreleri gibi bağışıklık hücrelerini doğrudan enfekte edebilir ve onlara zarar verebilir. Bu, bağışıklık hücrelerinin sayısında azalmaya ve bağışıklık sisteminin enfeksiyonlara yanıt verme yeteneğinde azalmaya yol açabilir.
* Bağışıklık fonksiyonunun bozulması. Çocuk felci virüsü, doğrudan enfekte olmasalar bile bağışıklık hücrelerinin işlevini de bozabilir. Örneğin çocuk felci virüsü, bağışıklık tepkisi için önemli moleküller olan antikorların ve sitokinlerin üretimini engelleyebilir.
* Otoimmünitenin tetiklenmesi. Bazı durumlarda, çocuk felci virüsü enfeksiyonu, bağışıklık sisteminin vücudun kendi dokularına saldırdığı bir durum olan otoimmünitenin gelişmesine yol açabilir. Bu, bağışıklık sistemi çocuk felci virüsü enfeksiyonu nedeniyle hasar gördüğünde veya düzensizleştiğinde ortaya çıkabilir.
Çocuk felci virüsünün bağışıklık sistemi üzerindeki etkileri, virüsün türüne ve bireyin bağışıklık durumuna bağlı olarak değişebilmektedir. Çoğu durumda, çocuk felci virüsü enfeksiyonu bağışıklık sisteminde uzun vadeli hasara yol açmaz. Ancak bazı durumlarda çocuk felci virüsü enfeksiyonu, kalıcı felçle sonuçlanabilecek paralitik çocuk felci gibi ciddi komplikasyonlara yol açabilir.