Bazı virüsler bağışıklık sistemini etkileyip bağışıklık sisteminin baskılanmasına neden olabilse de, genellikle bunu belirli bağışıklık hücrelerini enfekte ederek ve fonksiyonlarını bozarak yaparlar. Örneğin HIV, öncelikle bağışıklık sisteminin enfeksiyonlara karşı savunmasının önemli bileşenleri olan CD4+ T hücrelerini enfekte eden ve yok eden iyi bilinen bir virüstür. Kızamık ve grip gibi diğer virüsler, enfeksiyonun akut fazında geçici bağışıklık baskılanmasına neden olarak bireyleri ikincil enfeksiyonlara karşı daha duyarlı hale getirebilir.
Bu nedenle virüsün, bağışıklık sistemindeki hücrelere zarar veren veya onları öldüren kan yoluyla bulaşan bir enfeksiyon olduğunu söylemek doğru değildir.