Embriyonun cinsiyeti döllenme anında belirlenir. Yumurtayı dölleyen sperm X kromozomu taşıyorsa embriyo dişi olacaktır. Sperm Y kromozomu taşıyorsa embriyo erkek olacaktır.
Bir embriyonun cinsiyetini belirlemenin birkaç yolu vardır. Bunun bir yolu genetik testlerden geçiyor. Bu, embriyodan bir hücre örneği alınarak ve kromozomların analiz edilmesiyle yapılabilir. Embriyonun cinsiyetini belirlemenin bir başka yolu da ultrasondur. Bu, embriyonun görüntülerini oluşturmak için ses dalgalarını kullanan, invaziv olmayan bir prosedürdür. Embriyo erkek ise ultrason penisin varlığını gösterecektir. Embriyo dişi ise ultrason penisin varlığını göstermez.
Embriyonun cinsiyeti amniyosentez yoluyla da belirlenebilir. Bu, amniyotik keseye bir iğnenin sokulduğu ve amniyotik sıvıdan bir numunenin alındığı bir prosedürdür. Amniyotik sıvı daha sonra SRY geninin varlığı açısından test edilebilir. SRY geni mevcutsa embriyo erkektir. SRY geni mevcut değilse embriyo dişidir.
Amniyosentez, ultrasona göre daha invaziv bir işlemdir ve küçük bir düşük yapma riski taşır. Ancak embriyonun cinsiyetini belirlemenin daha doğru bir yoludur.