1) Patojenik etkileşimler: Bazı bakteriler insanlarda zatürre, tüberküloz, kolera ve gıda zehirlenmesi gibi hastalıklara neden olur.
2) Ortak etkileşimler: Diğer bakteriler ise insanların üzerinde veya içinde herhangi bir zarar vermeden yaşarlar. Bu bakteriler sindirim, besin sentezi ve zararlı patojenlerden korunmada rol oynayabilir.
3) Karşılıklı etkileşimler: Başka bakteriler de insanlara fayda sağlıyor. Örneğin, bazı bakteriler insanların yiyecekleri sindirmesine, antibiyotik üretmesine ve zararlıları kontrol etmesine yardımcı olur.
4) Çevresel etkileşimler: Bakteriler çevrede önemli roller oynar. Organik maddenin ayrıştırılmasına, besin maddelerinin geri dönüştürülmesine ve atmosferdeki nitrojenin sabitlenmesine yardımcı olurlar.