Bazı bakteriler damıtılmış suda geçici olarak canlı kalabilse de, gerekli besin maddelerinin bulunmaması nedeniyle büyümeleri ve üremeleri ciddi şekilde sınırlıdır. Zamanla bakteriler hareketsiz hale gelir veya sonunda yok olur.
Bununla birlikte, damıtılmış suyun, yanlış kullanım veya kirlenmiş yüzeylerle temas gibi dış bakteri kaynaklarına maruz kalması durumunda kirlenebileceğini belirtmekte fayda var. Bu gibi durumlarda, özellikle suyun uygunsuz şekilde depolanması durumunda belirli bakteri türleri hayatta kalabilir ve hatta çoğalabilir.
Damıtılmış suyun güvenliğini sağlamak için uygun saklama ve taşıma prosedürlerini takip etmek çok önemlidir. Buna, damıtılmış suyun temiz ve sterilize edilmiş kaplarda saklanması, potansiyel kontaminasyon kaynaklarıyla temastan kaçınılması ve derhal kullanılması da dahildir. Ek olarak, sıkı mikrobiyolojik kontrol gerektiren uygulamalarda damıtılmış suyun, steril veya arıtılmış suyun yerini alamayacağını unutmamak önemlidir.