Belirlilik: Farklı antijenler, bağışıklık sisteminin bunları ayırt etmesine ve her birine karşı spesifik antikorlar üretmesine olanak tanıyan farklı yapılara sahiptir.
Tepkisellik: Antijenler spesifik olarak kendilerine karşı üretilen antikorlarla reaksiyona girer. Bu reaksiyon birçok immünolojik tahlilin temelini oluşturur.
Yabancılık: Antijenler vücuda yabancıdır, yani normalde vücutta bulunmazlar. Bağışıklık sistemi yabancı antijenleri tanıyacak ve onlara yanıt verecek şekilde programlanmıştır.
Boyut, Şekil ve Karmaşıklık: Antijenler, küçük moleküllerden proteinler ve polisakkaritler gibi büyük karmaşık yapılara kadar boyut, şekil ve karmaşıklık açısından büyük farklılıklar gösterebilir.
Antijenik belirleyiciler veya Epitoplar: Bir antijenin bir antikora bağlanan kısmına antijenik determinant veya epitop denir. Antikorun tanıdığı ve bağlandığı spesifik bölgedir.