Mesane enfeksiyonlarına genellikle bakterilerin üretraya girip mesanede çoğalması neden olur. Böbrek taşları doğrudan mesane enfeksiyonlarına neden olmaz. Ancak böbrek taşları idrar yolunda tıkanıklık oluşturabilir, bu da bakterilerin çoğalmasını ve enfeksiyona neden olmasını kolaylaştırabilir. Böbrek taşları idrar yolundaki dokuya zarar vererek enfeksiyona daha duyarlı hale getirdiğinde de mesane enfeksiyonları ortaya çıkabilir. Ayrıca bazı böbrek taşı türleri mesaneye yayılıp enfeksiyona neden olabilecek bakteriler içerebilir. Bu nedenle böbrek taşları doğrudan mesane enfeksiyonlarına neden olmasa da enfeksiyonun gelişmesini kolaylaştıracak koşullar yaratabilirler.