Boğmacanın kökeninin çok eskilere dayandığına inanılıyor ancak kesin kökeni bilinmiyor. 1. yüzyıldan önce bile Avrupa ve Asya'da yaygın olarak yayıldığı düşünülüyor. Boğmacayla ilgili en eski yazılı kayıt, 6. yüzyıldan kalma bir Çin tıbbi metninde bulunur. 16. yüzyılda Amerika'da muhtemelen Avrupalı kaşifler ve sömürgeciler tarafından getirilen boğmaca öksürüğü ortaya çıktı. "Boğmaca" terimi İngilizce'de ilk kez 1658'de ortaya çıktı ve hastalığa neden olan bakteri *Bordetella pertussis*, 1906'da Fransız bakteriyolog Jules Bordet ve meslektaşı Octave Gengou tarafından tanımlandı.