Trakea kıkırdak, bağ dokusu ve kastan oluşan esnek, tüp benzeri bir organdır. Bağlar ve kaslar tarafından bir arada tutulan 16-20 C şeklinde kıkırdak halkasından oluşur. Bu kıkırdak halkaları destek sağlar ve nefes borusunun çökmesini önler. Trakeanın iç astarı, hava yollarını yabancı parçacıklardan korumaya yardımcı olan mukus üreten hücreleri içeren siliyer psödostratifiye kolumnar epitelden oluşur. Trakea, toz, polen ve diğer yabancı parçacıkları yakalamak için mukus salgılayan siliyer psödostratifiye kolumnar epitel ile kaplıdır. Kirpikler dalga benzeri bir hareketle atarak mukusu ve sıkışan parçacıkları boğaza doğru yukarı doğru iter, burada yutulabilir veya öksürerek dışarı atılabilir.