MRT ve MR sıklıkla birbirinin yerine kullanılır ancak ikisi arasında küçük bir fark vardır. MRT teknolojinin orijinal adıdır, MRI ise şu anda yaygın olarak kullanılan daha modern bir terimdir. MRT dünyanın bazı yerlerinde hala kullanılmaktadır ancak MRI daha yaygın bir terimdir.