Koni biyopsisi prosedüründe hasta genellikle litotomi pozisyonunda konumlandırılır. Bu, üreme organlarına erişim sağlamak için bacaklar bükülmüş ve üzengi üzerinde konumlandırılmış şekilde sırt üstü yatmayı içerir. İşlem sırasında daha iyi görüş sağlamak için hastadan mesanesini boşaltması da istenebilir.