İşlem sırasında cerrah önce fistülün yerini belirleyecek ve ardından etrafına bir dikiş veya dikiş yerleştirecektir. Daha sonra dikiş atılacak ve fistül kapatılacak ve iki organ veya vücut boşlukları arasında daha fazla sızıntı veya iletişim önlenecektir.
Fistül ligasyonu açık cerrahi, laparoskopik cerrahi ve endoskopik cerrahi gibi çeşitli teknikler kullanılarak gerçekleştirilebilir. Kullanılan spesifik teknik fistülün konumuna ve hastanın bireysel durumuna bağlı olacaktır.
Fistül ligasyonu nispeten yaygın bir cerrahi işlemdir ve genellikle altta yatan tıbbi durumun veya komplikasyonun tedavisinde başarılı olur. Ancak her ameliyatta olduğu gibi enfeksiyon, kanama ve çevre organların zarar görmesi gibi potansiyel riskler ve komplikasyonlar vardır.