Bir organ bir kişiden (donörden) diğerine (alıcıya) nakledildiğinde, alıcının bağışıklık sistemi, donörün organını yabancı olarak tanır ve ona karşı bir bağışıklık tepkisi oluşturur. Bu bağışıklık tepkisi, nakledilen organa zarar verebilir veya yok edebilir, bu da naklin reddedilmesine yol açabilir.
Alıcının bağışıklık sistemini baskılayan ve nakledilen organa saldırmasını önleyen bağışıklık baskılayıcı ilaçlarla doku reddi önlenebilir. Bununla birlikte, bağışıklık sistemini baskılayan ilaçların enfeksiyon ve kanser riskinin artması gibi yan etkileri de olabilir.